菜花大多長在黏膜和皮膚的交界處，例如外陰部、陰莖、肛門和嘴唇等處，剛開始是在患部出現不痛不癢的小丘疹，漸漸增生成簇。潛伏期約1到3個月甚至更久，大多發生在年輕人身上，20─40 歲的患者約佔7成，女性的菜花患者約佔其中的 67％，較男性患者多，根據統計，在15─50歲的人口中約有1％的人曾經感染過菜花。
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